Une controverse est une discussion argumentée, une contestation sur une opinion, un problème, un phénomène ou un fait.
Une controverse peut être liée à deux conceptions de la vérité différentes. Par exemple, pour le modèle du système solaire, la conception des scientifiques comme Galilée, s’appuie sur l’observation et sur la conformité des prédictions avec les faits observés. La conception de l’Église, à l'époque, s’appuie sur les Écritures.
La controverse est de nature scientifique lorsque deux modèles construits sur des arguments scientifiques s'affrontent. C'est le cas des modèles de Tycho Brahé et de Copernic. Pour être résolue, il faut souvent de nouveaux résultats expérimentaux ou de nouvelles observations. Le modèle de Tycho Brahé n'a pas résisté à la découverte des parallaxes stellaires deux siècles plus tard, ce qui a confirmé le modèle de Copernic.
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